Cell Res:北京基因组所合作揭示 RNA 突变调控 R -loop 形成及转录终止

2022-01-03 05:16:51 来源:
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R-loop 是一种由 RNA:DNA 杂合脱氧核糖核酸和单脱氧核糖核酸 DNA 组成的特殊核酸构件,在原核和真核生物的遗传组中都特有种普遍且普遍存在。R-loop 在很多更为重要的生态学更进一步中都造就重要动态,包括染色质省略、RNARNA、DNA 挫伤复原以及遗传组保持稳定性等,但其如何被精确RNA的前提尚不清楚。m6A 省略作为早先 RNA 上丰度最高的省略型式,普遍加入爬行动物的退化、特异性、肿瘤核更新、脂肪分化、以及生成和转移等生命更进一步。然而,目前尚不清楚 m6A 是否能作为 R -loop 中都 RNA 溶质的本源特征来RNA R -loop 准确度,进而造就各种生态学动态。中都科院天津遗传组研究者所杨运桂、任捷与清华大学生科院孙前文一个团队合作开发研究者,辨认出 m6A 能保持稳定 R-loop 的产生,进而RNA遗传RNA的有效性延后。这一更必要性以《m6A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination》纪实于 10 月末 12 日在线发表于《细胞核研究者》(Cell Research)杂志。研究者一个团队首先通过斑点分子育种和特异性荧光电子技术,辨认出敲低 m6A 甲基转移酶 METTL3 显着增大 R -loop 准确度,且该RNA起到比如说 METTL3 甲基转移酶活性。随后,一个团队成员依靠高效液相色谱建立联系质谱电子技术,辨认出相较于染色体转化的 RNA(caRNA),R-loop 的 RNA 溶质有更加富集的 m6A 省略。必要性依靠基于单脱氧核糖核酸 DNA 建库的 DNA:RNA 杂合脱氧核糖核酸特异性共约沉淀高通量DNA电子技术(ssDRIP-seq),辨认出下调的 R -loop 主要富集在RNA延后区域,R-loop 变异程度与 m6A 的距离和省略准确度特别。为了探索 m6A 对 R -loop RNA的生态学动态,研究者一个团队绘制了 RNA PCRRNA核苷酸的高质量图谱,并在 MYC、ACTIN 遗传上进行多种RNA活性检测,辨认出 m6A 作出贡献 R -loop 产生是RNA延后阶段的更为重要步骤,可以防止 RNA PCR的RNA通读。最后,一个团队成员构建了针对RNA通读的报告遗传管理系统,通过 m6A 省略核苷酸的突变必要性证实 m6A 对于 R -loop 产生及RNA延后的更为重要起到。该研究者辨认出了 m6A 丝氨酸省略的共约RNARNA动态,探究了 RNA 丝氨酸省略对染色质构件的影响,以及 R-loop 构件中都的 RNA 溶质被省略后对其自身稳态的RNA前提,阐述了 m6A 通过保持稳定 R-loop 而作出贡献RNA较长时间延后的现象,为必要性研究者 m6A 与 R-loop 的RNA前提和相应生态学动态提供了基本的电子技术和理论支架。该研究者想得到了中都国科学院战略性先导科技专项、国家所自然科学以及国家所重点开发计划等基金资助。完整出处:Xin Yang, Qian-Lan Liu, Wei Xu, et al. m6A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination. Cell Research (2019).
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